Das sind tatsächlich begründete Sorgen. Daher wäre es vielleicht auch nicht verkehrt, ihm den Käfig wieder etwas schmackhaft zu machen, falls er darin mal verweilen muss (was definitiv kein Dauerzustand sein soll). Ggf. würde ich den Boden auch auspolstern und ihm Leitern zur Verfügung stellen, damit er eigenständig wieder nach oben kommt.
Ich hoffe sehr, dass er sich schnell erholt und die Federn wirklich nur durch die Milben so sind und sich das in Kürze wieder verbessert.